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仕事

interproscan update 3

후... 무수한 core dump들이 뜨고, 그 후의 결과물 사이즈가 좀 달라서

core dump가 안뜰 때까지 설정값 삽질을 했다.

결과적으로 보자면, 원인은 sge node worker의 job 분배와 메모리 할당에

문제가 있어서 core dump들이 뜬 것 같다. 이게 이전 버전과 다른 점이 뭐냐하면...

초반부터 엄청나게 core dump들이 발생한다. 그리고 어떻게든 결과물이 나오는데.. (이전 버전은 fault 메세지와 함께 다운)

32 threads workstation에서의 결과값과 비교해보자면, 에러가 지속적으로 발생하면 

그 데이터를 빼버리는게 아닌가하는 생각이 든다. (그러니 결과값이 작아지지..)

여튼 그래서 에러가 나지 않을 정도로 job 분배를 하게 만들었다.


이젠 resaonable한 크기의 결과값이 얻어진다. 이 정도면 됐지 뭐... -_-;;

당분간은 이 세팅대로 써야겠음. 


그리고 ipr에 대해서는 zulu1보다 oracle-jdk가 좀더 빠름.