본문 바로가기

Bioinformatics

CEGMA

교수님께서 필요하시다해서 지난밤에 깔아서 돌려본 프로그램.

설치하기는 쉬운데 plug-in 설치하기가 좀 .......같다. 특히 gene-wise가 -_-;;

ubuntu 쓰시는 분들은 그냥 apt-get install wise와 wise-data하시길. 환경변수 안써도 됨.

아마 compile하다가는 짜증이 좀 날 것임... glib-config땜시...

이걸로 검색해서 들어오시는 분들도 분명히 있을 듯. 편히 우분투 쓰세요.

그리고 hmmer 최신 버전 쓰면 아마 검증 안된 버전을 쓴다고 경고가 뜰텐데, 무시해도 됨.

결과값은 같음. 올해 버전업된 프로그램이 왜... 2012년 버전의 hmmer을 쓰고 있는지는 알 수가 없다.

모 대학 연구실에서 같은 소스로 다른 결과가 나와서, 여러 방법으로 검증 중인데 (내가 틀렸는지 검증 스스로 체크 중)

내가 틀린 것 같진 않다. CEGMA 개발한 쪽에서 제공한 virtual box 이미지로도 체크하는 중이고

sample data 결과는 이미 같게 나왔다. virtual box나 개발자 쪽에서 제공한거나, 내꺼나 다 똑같음.