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仕事

GNU Parallel

써보니 상당히 강력하다.

blast에 적용해보니 클러스터 서버의 경우 성능이 3배 정도 더 좋아진 것 같다.

다만... 연구실 워크스테이션 같은 (상대적으로) 낮은 클럭의 많은 코어를 가진 cpu에는

적합하지 않은 것 같다. 높은 클럭의 cpu로 구성되어 있는 클러스터 서버에는 유용함.

query size는 알아서 잘 조절해야겠지만 말이다.


그나저나... 클러스터 서버 램을 좀 증설해야할텐데... 이것도 큰 삽이라 망설여진다.