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仕事

I-Tasser cluster app 세팅 -1

protein structure prediction 프로그램들을 몇가지 알아보았는데... 제일 나은게 이것 같다.

그런데 이게 계산하는 것이 워낙에 많다보니, single thread로는 너무 느리다.

거기에다가 이 프로그램은 multi-thread를 지원하지 않는다. 그러므로.... 답은 HPC-cluster를 통한

고속화 밖에 답이 없음. 




그런데 이 I-Tasser의 parallel mode script가 PBS 기준임 -_-;;

SGE를 쓰는 나로서는 손을 보는 수 밖에 없는데...


이건 다시 정리해서 올리도록하고, 일단은 돌아가는지 아침에 확인해야겠음.

결국 오늘도 다섯시에 자는구나.... OTL