http://arima.tistory.com/116
에 나온대로 해봤는데... 글쎄다...
그닥 빠르다는 느낌을 못 받음. 물론 환경이 달라서 그런 것일수도 있겠지만...
8 core로 해보고 결과를 보면 되겠지.
- 해보니까, 8 core 하나로 하는 것보다 4 core 2개로 작업을 구성하는 것이 나은 것 같다.
다만... 램이 충분해야겠다. 32기가는 되어야 될 듯...;;
그리고오... blast+보다 legacy blast (blastall)이 더 빠른 것 같다.
결과값만 비슷하다면 blastall로 전부 변경하는게 어떨까... 싶다.
어차피 nicem에서 쓰는 것도 legacy blast로 보이니까 말이지.
ncbi에서는 blast+가 더 빠르다는데, 왜 이런 결과값이 나오는 것일까?
- 램이 모자란건지... 일부 시퀀스에서 지나치게 오래 걸리는 경우가 있어서, 일단 8 core로 실시.
효율도 중요하긴하지만, 결과가 나오는 것도 중요하니까.
