2015/01 (6) 썸네일형 리스트형 Teamviewer Ver.10 이번에 연구실 워크스테이션 및 서버들에 teamviwer 새 버전을 업데이트해줬다. 새로 깐 것들도 있고. 그 결과... 벌써 두 대가 제때 접속이 안되는 일이 벌어졌다. -_-;;거기에 중간중간 끊어지는 일들도 여러번. 맥버전은 이전보다 좋아지긴 했다.전체화면 모드에서 귀찮은 일이 줄었는데... 그럼 뭐하나. 불안정해졌는데... 이래서야 쓸 수가 없다. 모두 이전 버전으로 다운그레이드 해야겠다.쩝... 건드리지 말걸. ㅠㅠ 근황.... 젠장... 도대체 같은 일을 몇 번을 반복해서 하는건지...일의 기준을 마련해놓고 하라고 해야할거 아닌가...해놓고 아닌 것 같다고 다시 하고... 미쳐버리겠구만...내가 다 알고, 알아서 했어야 하는건가 싶어버리네... genewise... & Ipr... 참 코드 그지같이 만들어놨다 싶음. 배포본마다 에러 메세지 다 다르고, 일부는 없는 함수 참조하는게 넘 많아서 고치기도 짜증나는 상태. 솔직히 지금 시스템에 잘 돌아가는데, 검증때문에 다운을 해야하는 상황. Ipr은 램 업글을 해도 에러를 나길래, 프로세스당 램사용률 말고, 프로세스당 cpu 사용률을 조절함. 아직은 문제 없어보이지만... 전반적인 세팅에 좀더 신경을 써야겠다. 암튼 자바로 만든건 다 싫어! CEGMA 교수님께서 필요하시다해서 지난밤에 깔아서 돌려본 프로그램.설치하기는 쉬운데 plug-in 설치하기가 좀 .......같다. 특히 gene-wise가 -_-;;ubuntu 쓰시는 분들은 그냥 apt-get install wise와 wise-data하시길. 환경변수 안써도 됨.아마 compile하다가는 짜증이 좀 날 것임... glib-config땜시...이걸로 검색해서 들어오시는 분들도 분명히 있을 듯. 편히 우분투 쓰세요.그리고 hmmer 최신 버전 쓰면 아마 검증 안된 버전을 쓴다고 경고가 뜰텐데, 무시해도 됨.결과값은 같음. 올해 버전업된 프로그램이 왜... 2012년 버전의 hmmer을 쓰고 있는지는 알 수가 없다.모 대학 연구실에서 같은 소스로 다른 결과가 나와서, 여러 방법으로 검증 중인데 (내.. GNU Parallel 써보니 상당히 강력하다.blast에 적용해보니 클러스터 서버의 경우 성능이 3배 정도 더 좋아진 것 같다.다만... 연구실 워크스테이션 같은 (상대적으로) 낮은 클럭의 많은 코어를 가진 cpu에는적합하지 않은 것 같다. 높은 클럭의 cpu로 구성되어 있는 클러스터 서버에는 유용함.query size는 알아서 잘 조절해야겠지만 말이다. 그나저나... 클러스터 서버 램을 좀 증설해야할텐데... 이것도 큰 삽이라 망설여진다. GNU Parallel Article describing tool (for citations):O. Tange (2011): GNU Parallel - The Command-Line Power Tool, ;login: The USENIX Magazine, February 2011:42-47.Authors' website for obtaining code:http://www.gnu.org/software/parallel/All new computers have multiple cores. Many bioinformatics tools are serial in nature and will therefore not use the multiple cores. However, many bioinformatics tasks (especi.. 이전 1 다음